西罗马帝国于公元476年瓦解后，东罗马皇帝查士丁尼一度统一了古罗马帝国。这位战功显赫的皇帝的确从蛮族手中夺回了帝国的大片领土，而且他还使拜占庭帝国的文化艺术兴盛一时，但也是他于公元529年下令封闭了雅典的所有学校包括柏拉图学园。这一由柏拉图亲手创建、持续了900多年的希腊学术据点被拔掉了。
查士丁尼封闭柏拉图学园主要是因为宗教原因。当时，基督教已成为拜占庭的国教。由于教会视希腊学术为异端邪说，查士丁尼为讨好教会，只好对雅典下毒手。不过，与西方的罗马教会不同，拜占庭的教会势力并不强大，难敌世俗政权，也未能垄断世俗文化的发展，因此，拜占庭文化带有很强的古典特色。特别应该指出的是，拜占庭的建筑艺术光辉夺目，是这个黑暗年代里罕见的星光。被封闭的柏拉图学园中的希腊哲学家们，包括著名的亚里士多德的注释者辛普里丘，一开始都去了波斯，但不久后就发现，拜占庭比波斯更适合他们，所以大部分又来到了这里。
在君士坦丁堡，出现了古代世界最后一位希腊化科学家，他就是普罗克罗。此人410年生于君士坦丁堡，接受的是希腊式教育，是当时希腊化世界中广泛流行的新柏拉图主义的信徒。他后来又到了雅典，在柏拉图的学园里教学，并成了那里的学长。普罗克罗留下了几部对托勒密和欧几里得的注释，这些注释有着重要的科学史意义。公元485年4月17日，普罗克罗在雅典去世。
