拿破仑在马伦哥和霍亨林登战役之后就开始对德意志主体部分进行重组，到这时，重组的工作已基本上完成。他将组成德意志体系的300多个邦国缩减为40个左右。其中宗教邦、帝国自由城市和小王公的小国成为主要的受害者，他们的大部分土地被强行授予那些保留下来邦国的王公。其中最受宠的是巴伐利亚选帝侯（Elector of Bavaria）和符腾堡公爵（Duke of Württemberg），他们都被拿破仑封为国王并获得了足够多的领土来适当地维持他们的尊荣。巴登侯爵（Margrave of Baden）被封为大公，他的领地得到扩大。所有这些王公都和拿破仑家族联姻。
这些最受宠的邦国连同其他的邦国——共有16个，宣布从古老的神圣罗马帝国中独立出来，成立一个名为莱茵邦联的政治联盟，拿破仑是这个联盟的保护者。神圣罗马帝国皇帝弗朗茨二世意识到自己的权力实际上已经被废除，于是放弃神圣罗马帝国皇帝的头衔，开始采用奥地利皇帝弗朗茨一世作为最高头衔。
就这样，神圣罗马帝国在查理曼之后维持了将近千年，最终灭亡。如果从恺撒·奥古斯都开始算起，罗马帝国存在了1800年，是最长寿的人类秩序之一——如果把这种存在看作生命的话。
