恐怖统治持续了9个月后引起了反抗。共和国军队的胜利和各地国民公会权力的建立使人们认为每天发生的大规模屠杀既残忍又没有必要。他们开始对屠杀感到厌恶，对被处死的人表示同情。罗伯斯庇尔成为了人民清算的第一个目标。国民公会宣布他和追随者都是共和国的敌人。罗伯斯庇尔被逮捕，后来被巴黎的暴徒营救，随后又被逮捕并直接送上了断头台，同他一起被处死的还有他的几个朋友和巴黎革命公社的绝大多数成员。
罗伯斯庇尔和他的追随者被肃清后，人民的反抗仍然继续进行。人民要求惩罚恐怖主义者。雅各宾俱乐部被关闭，这个曾经集结和指引很多城市暴徒的机构终于解散。基督教崇拜再次被建立起来。
