圣巴托洛缪大屠杀并没有消灭法国的新教徒，相反，它更加激发了胡格诺派保卫自己信仰的决心。法国因此而完全陷入动荡和战争的旋涡。最终在1589年，当时的法国国王亨利三世被刺杀。他的死宣告瓦卢瓦王朝的终结。纳瓦拉国王波旁的亨利四世多年来一直是胡格诺派最突出的领袖，现在他登上王位，成为波旁王朝的第一位法国国王。他的即位让欧洲最著名的王室之一变得举足轻重，从此时起到法国大革命和革命后的一段时期，法国乃至整个欧洲的政治史，在很大程度上都是波旁王朝的历史。
亨利四世（Henry IV）得到和维持王位颇为不易。当时的法国仍然是一个天主教占主导地位的国家，天主教徒还没有准备好接受一位新教的君主。天主教徒宣称支持亨利的叔叔波旁红衣主教，法国因此陷入内战的旋涡。
