第一次犹太起义
牛津大学犹太学教授马钉古德曼（Martin Goodman）表明，犹太人起义的原因有很多，包括统治者的无能、罗马统治者的压迫、犹太人的宗教敏感、阶级间的紧张关系，以及与外邦人的争斗和社会的分崩离析。公元66年4月，冲突爆发。当时，罗马地方财政官格修斯·弗劳鲁斯（Gessius Florus）掠夺圣殿珍宝的行为激怒了耶路撒冷人，他们公开嘲笑罗马总督，而总督则用十字架处死起义者作为回敬。对罗马军队的袭击始于公元67年。当时，瓦斯帕西亚（Vespasian）指挥3个军团、23个预备队、6支骑兵队以及其他一些雇佣军，总共6万余人挺进加利利（包括第比利斯、基士拉和约塔帕塔）。公元68年与69年之交，加利利陷落，对耶路撒冷的围攻也展开了。德·沃认为，就在此时，基伯特－库姆兰阶段II因战乱而结束，其根据是灰土层和残存的箭头。
就在耶路撒冷城被围，甚至罗马军队兵临城下的危急时刻，城内不同的犹太人派别正在闹内讧。奋锐党人组建了军事和政治力量，在耶路撒冷圣殿的纯洁性问题上群情激昂。他们把耶路撒冷划分为不同的控制区，分别由3个主战派领导人掌控，他们是西缅·巴奇拉（Simon bar-Giora）、其儿子以利亚撒（Eleazar）和基士拉的约翰（John of Gischala）。与此同时，瓦斯帕西亚因被宣布为皇帝而返回罗马，把围攻耶路撒冷的任务交给了儿子提图斯。犹太历阿布月（相当于公历7月或8月）9日，提图斯控制了耶路撒冷的上城和圣殿山。男人、妇女和儿童惨遭杀戮，城市被夷为平地。圣殿也被焚毁，尽管提图斯本想放过它。耶路撒冷的毁灭至今仍为犹太人所纪念，他们在这一日实行全天斋戒，名曰“提沙－巴乌”（tisha be'Ab，阿布月第9日）。
夺取耶路撒冷后，由鲁西琉斯·巴苏斯（Lucilius Bassus）指挥，旋又由弗拉维乌斯·西尔瓦统率的罗马军队，攻克了犹地亚沙漠中的诸多要塞。犹太人抵抗的最后一个据点是马萨达要塞。斯卡利人（The Sicarii），即一批以使用弯刀（拉丁文为sica）闻名的党徒，在残杀了那些屈从于罗马统治的犹太人后，继续在要塞抵抗，最后于公元74年集体自杀。据信，这也是基伯特－库姆兰第III阶段居住期的结束。
