既然经济和政治问题皆归诸于道德范畴内，对于托马斯来说，宗教似乎应置于政治与工业之上，并且有关道德方面的事物，国家应接受教会的监督和指示。权威性越高，其终极的目的也越高。指引人们得到一般世间福祉的尘世国王，必须服从指引人们走向永恒幸福的教皇。国家对世俗之事仍保留至高无上的权力，但即使是这些事情——如统治者违反了道德的规律，或对百姓造成一些原可避免的伤害——教皇仍可干政。因此，教皇可惩罚一个失职的国王，或解除臣民履行效忠君主的誓言。进一步说，国家必须维护宗教，支持教会并强制执行其教令。
教会最重要的功能在于引人得救。人不仅是尘世的公民，而且是一个超越国界而更广泛的精神王国的子民。历史的事实告诉我们，人类违反了神的意旨而犯了极大的罪，应受极大的惩罚；而神子降世为人，忍受羞辱及死亡的痛苦，开创了人类得救赎罪的新机与恩典。借此，人类虽有其原罪而可得救。上帝随自己的意旨而颁赐恩典，我们无法彻底明白他的抉择的理由，但“没有人如此狂妄地认为自身的美德是神预定赐予恩典的原因”。保罗和奥古斯丁的令人颤惧的教律在温和的托马斯身上重现：
神应该决定人类的命运，这是合理的。因为所有的事都在神的旨意下……既然人经由神意而注定其永恒的生命，同样地，准许有些人不能获得永生亦是神的意旨之一部分，这就叫作定罪……既然天意之中包括赐予恩典与荣耀的意旨，因此定罪也包括应允一个人陷入罪恶，并因此罪恶受到永久的处罚……“他从创立世界以前，在基督里拣选了我们。”
托马斯努力调和神圣天意的宿命论与人类自由，并解释为何一个人的命运已被注定，还应努力向善，祈祷如何能感动不改变的上帝，及教会在一个其成员已被注定可得救或遭天谴的社会里，所应运作的功能。他回答说上帝只预知每个人将如何自由地选择，并假定除了少数得到上帝给予特殊及单独的启示之外，所有的异教徒都属于被定罪的。《神学大全》的《补遗篇》中，一段常被人引用的话，说到在天堂里享福的人，因见被咒入地狱者所受的痛苦，就越觉得自己有福。这段文句一般怀疑其不是出自托马斯的手笔，而是皮佩诺的雷金那德所写的。
得救的人的最大快乐在于得见上帝，却并非了解上帝，只有上帝才能了解他自己。然而，因着神恩典的赐予，蒙福的人能了解上帝的本质。受造的万有都是本于上帝，也归于上帝；人的灵魂是上帝恩典的恩赐，只有回归根源时方得安息。如此，创造与返回的神圣循环完成，而托马斯的哲学正如其开始，也以上帝为结束。
